Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dkk3Q9QUN9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms