Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cln8Q9QUK3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cln8Q9QUK3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cln8Q9QUK3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cln8Q9QUK3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms