Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SrfQ9JM73 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrfQ9JM73 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms