Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Reep6Q9JM62 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Reep6Q9JM62 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms