Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rabgef1Q9JM13 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rabgef1Q9JM13 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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