Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Tgm1Q9JLF6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Tgm1Q9JLF6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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Tgm1Q9JLF6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Tgm1Q9JLF6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Tgm1Q9JLF6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Tgm1Q9JLF6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Tgm1Q9JLF6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Tgm1Q9JLF6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Tgm1Q9JLF6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Tgm1Q9JLF6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Tgm1Q9JLF6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tgm1Q9JLF6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms