Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CubnQ9JLB4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CubnQ9JLB4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CubnQ9JLB4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CubnQ9JLB4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CubnQ9JLB4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CubnQ9JLB4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CubnQ9JLB4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CubnQ9JLB4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CubnQ9JLB4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CubnQ9JLB4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
CubnQ9JLB4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CubnQ9JLB4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
CubnQ9JLB4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CubnQ9JLB4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CubnQ9JLB4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CubnQ9JLB4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CubnQ9JLB4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms