Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Slc5a3Q9JKZ2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc5a3Q9JKZ2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms