Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scamp4Q9JKV5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scamp4Q9JKV5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms