Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
AtrQ9JKK8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms