Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stx6Q9JKK1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stx6Q9JKK1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms