Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms