Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trem1Q9JKE2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trem1Q9JKE2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms