Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Scamp5Q9JKD3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp5Q9JKD3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 220.3 ms