Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bco1Q9JJS6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Bco1Q9JJS6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bco1Q9JJS6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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