Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smad9Q9JIW5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms