Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmbr1Q9JIT0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms