Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp1r3fQ9JIG4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppp1r3fQ9JIG4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp1r3fQ9JIG4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms