Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lgi1Q9JIA1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms