Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LratQ9JI60 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LratQ9JI60 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms