Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Tmod3Q9JHJ0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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Tmod3Q9JHJ0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Tmod3Q9JHJ0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Tmod3Q9JHJ0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Tmod3Q9JHJ0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Tmod3Q9JHJ0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Tmod3Q9JHJ0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Tmod3Q9JHJ0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Tmod3Q9JHJ0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Tmod3Q9JHJ0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
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Tmod3Q9JHJ0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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Tmod3Q9JHJ0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmod3Q9JHJ0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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