Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tcirg1Q9JHF5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tcirg1Q9JHF5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms