Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rb1cc1Q9ESK9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Rb1cc1Q9ESK9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rb1cc1Q9ESK9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms