Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp29Q9ES63 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp29Q9ES63 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms