Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3bQ9ES34 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3bQ9ES34 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3bQ9ES34 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3bQ9ES34 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube3bQ9ES34 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube3bQ9ES34 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube3bQ9ES34 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube3bQ9ES34 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube3bQ9ES34 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube3bQ9ES34 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube3bQ9ES34 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube3bQ9ES34 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Ube3bQ9ES34 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Ube3bQ9ES34 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
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Ube3bQ9ES34 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Ube3bQ9ES34 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube3bQ9ES34 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube3bQ9ES34 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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