Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trhr2Q9ERT2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trhr2Q9ERT2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms