Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERC3

Sertad3, SERTA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sertad3Q9ERC3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sertad3Q9ERC3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sertad3Q9ERC3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms