Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dap3Q9ER88 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dap3Q9ER88 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms