Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Capn12Q9ER56 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Capn12Q9ER56 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms