Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ndst3Q9EQH7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ndst3Q9EQH7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms