Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Vmn1r44Q9EQ47 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Vmn1r44Q9EQ47 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Vmn1r44Q9EQ47 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Vmn1r44Q9EQ47 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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