Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp1bQ9EPL6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp1bQ9EPL6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms