Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r53Q9EP93 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r53Q9EP93 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms