Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tspan4Q9DCK3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Tspan4Q9DCK3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tspan4Q9DCK3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tspan4Q9DCK3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tspan4Q9DCK3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tspan4Q9DCK3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tspan4Q9DCK3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tspan4Q9DCK3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tspan4Q9DCK3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tspan4Q9DCK3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tspan4Q9DCK3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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