Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpne8Q9DC53 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpne8Q9DC53 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms