Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syde1Q9DBZ9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syde1Q9DBZ9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms