Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Syvn1Q9DBY1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syvn1Q9DBY1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms