Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc97Q9DBT3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc97Q9DBT3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms