Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SrpraQ9DBG7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms