Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med29Q9DB91 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med29Q9DB91 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms