Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg9Q9DB90 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg9Q9DB90 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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