Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf580Q9DB38 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf580Q9DB38 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf580Q9DB38 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf580Q9DB38 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf580Q9DB38 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Znf580Q9DB38 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Znf580Q9DB38 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf580Q9DB38 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf580Q9DB38 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Znf580Q9DB38 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Znf580Q9DB38 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Znf580Q9DB38 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Znf580Q9DB38 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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