Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAQ7

3110070M22Rik, RIKEN cDNA 3110070M22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110070M22RikQ9DAQ7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
3110070M22RikQ9DAQ7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms