Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9DA42 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9DA42 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9DA42 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9DA42 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9DA42 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9DA42 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9DA42 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9DA42 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9DA42 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9DA42 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9DA42 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9DA42 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9DA42 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9DA42 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9DA42 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DA42 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DA42 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DA42 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DA42 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DA42 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DA42 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DA42 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DA42 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DA42 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DA42 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DA42 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DA42 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DA42 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DA42 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DA42 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DA42 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9DA42 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9DA42 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9DA42 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DA42 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DA42 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DA42 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DA42 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DA42 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DA42 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DA42 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DA42 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9DA42 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms