Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd9Q9D9M4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms