Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D9D9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D9D9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D9D9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D9D9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D9D9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D9D9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D9D9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D9D9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D9D9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms