Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot8Q9D8X5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot8Q9D8X5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms