Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D8Q6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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