Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D8N1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D8N1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D8N1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D8N1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8N1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8N1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9D8N1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms