Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc52a2Q9D8F3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc52a2Q9D8F3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms